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微生物所等解析大豆灰斑病菌基因組信息

更新時間:2017-09-21  |  點擊率:1637

  近日,中國科學院昆明動物研究所張亞平課題組與吳東東課題組合作,通過比較野生褐家鼠和實驗大鼠的基因組和轉錄組數據,解析了實驗大鼠的起源和馴化遺傳機制。相關研究成果發表在Molecular Biology and Evolution上。本文締一生物/締一生物為您分析微生物所等解析大豆灰斑病菌基因組信息。

   A.大豆灰斑菌的侵染循環;B-D.大豆灰斑病病癥及菌絲侵染特點;

  E.灰斑菌基因組的Circos-plot分析;F.致病基因簇

  實驗大鼠作為一種廣泛使用的模式動物,由野生褐家鼠馴化而來,也是一種家養動物。與其野生祖先褐家鼠相比,實驗大鼠在形態、行為及生理方面發生很大變化,但實驗大鼠的起源以及導致其被馴化成功的機制尚不清楚。

  研究人員利用群體遺傳學方法,FST與cross-population extended haplotype homozygosity (XP-EHH)等,在全基因范圍內掃描了野生褐家鼠與實驗大鼠群體之間出現分化的區域,發現大量神經系統基因在大鼠馴化過程中受到人工選擇作用,例如,在學習記憶方面起重要作用的FOXP2和B3GAT1,以及節律相關基因CLOCK。這些基因在實驗大鼠的神經組織中的表達水平顯著上調,有助于提高學習記憶能力。研究人員推測學習記憶能力的提高可能是實驗大鼠被馴化的關鍵。此外,基于轉錄組分析及qPCR數據揭示能量代謝相關基因在實驗大鼠大腦組織中顯著上調,這為進一步揭示實驗大鼠馴化的遺傳機制奠定了良好的基礎。

  該研究得到中科院先導B項目的資助。綜上所述,您是不是已經對微生物所等解析大豆灰斑病菌基因組信息,有所了解。如果還有其他疑問,請咨詢締一生物/締一生物資深專家。

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